Truy cập nhanh thư viện y khoa trên PubMeb
PubMed là công cụ không thể thiếu của những bác sĩ - nhà khoa học trong việc truy
tìm các tài liệu tham khảo có liên quan đến lãnh vực họ nghiên cứu. Vai trò thứ hai của
PubMed là giúp người truy cập có thể cập nhật hóa kiến thức y khoa. Chỉ cần đọc tựa bài
báo và phần tóm tắt, người đọc cũng có thể nắm được nội dung chính của bài báo, biết được
kết quả của nghiên cứu được công bố, từ đó biết được hướng nghiên cứu trên thế giới hiện
tại, những gì đã được nghiên cứu, những...
Truy cập nhanh thư viện y khoa trên PubMed
…………….........
Sưu tầm : Dr. Nguyen Hong Ninh
Faculté de Médecine de Thai Nguyen
Thư viện y khoa trên mạng PubMed do Viện Y Tế Quốc Gia Hoa Kỳ thành lập,
giúp truy cập vào Medline, bao gồm khoảng 9 triệu tựa bài báo đã được đăng trên 3.900 tạp
chí y khoa uy tín trên thế giới từ năm 1967 về sau. Tư liệu trên PubMed được cung cấp hoàn
toàn miễn phí, người truy cập chỉ phải trả tiền truy cập Internet. Không chỉ cho biết tựa bài,
tên tác giả, nguồn gốc của bài báo, Medline còn có thể cung cấp phần tóm tắt của đa số các
bài báo trên, giúp người truy cập có thể kết nối với một số địa chỉ (Website) của một số tạp
chí y khoa uy tín như BMJ (British Medical Journal) để có thể nhận được toàn bộ bài báo. Bài
viết xin trình bày phương pháp truy cập nhanh, chính xác, hiệu quả, lấy đủ thông tin và tiết
kiệm.
PubMed là công cụ không thể thiếu của những bác sĩ - nhà khoa học trong việc truy
tìm các tài liệu tham khảo có liên quan đến lãnh vực họ nghiên cứu. Vai trò thứ hai của
PubMed là giúp người truy cập có thể cập nhật hóa kiến thức y khoa. Chỉ cần đọc tựa bài
báo và phần tóm tắt, người đọc cũng có thể nắm được nội dung chính của bài báo, biết được
kết quả của nghiên cứu được công bố, từ đó biết được hướng nghiên cứu trên thế giới hiện
tại, những gì đã được nghiên cứu, những gì còn chưa ai nghiên cứu tới. Truy cập PubMed có
thể giúp người đọc nảy sinh một ý tưởng, một hướng nghiên cứu mới áp dụng vào hoàn
cảnh Việt Nam.
Như vậy chỉ cần truy cập vào địa chỉ www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed là một bác sĩ
có được những thông tin cần thiết cho việc điều trị và nghiên cứu khoa học.
C¸c bíc t×m th«ng tin trªn PubMed
Bước một, trên trang chủ (homepage) của PubMed, vào mục "Search", chọn Medline
(theo mặc định), trong ô "for" đánh vào mục cần tìm bằng tiếng Anh. Tránh sử dụng tính từ
(adjective) mà nên sử dụng danh từ kép (compound noun) theo dạng danh từ + danh từ (noun
+ noun). Ví dụ để tìm các tài liệu có liên quan đến sỏi thận, không nên đánh "renal stone" mà
nên đánh "kidney stone", hay để tìm ung thư phổi thì nên đánh "lung cancer", chứ không nên
đánh "pulmonary cancer". Không nên đánh từ cần tìm quá chi tiết. PubMed sẽ gặp khó khăn
khi "hiểư" những câu dài. Tiếp theo, trong mục "Số tài liệu mỗi trang"(numbers of documents
to display per page), theo mặc định là 20, nên chọn số cao nhất là 5000 để dễ lưu trữ và đỡ
mất thời giờ. Nếu chọn 20 thì nếu có hơn20 tài liệu (trong hầu hết trường hợp), cứ sau mỗi
trang gồm 20 tài liệu, lại phải chọn "next page", lại phải chờ tải xuống (download) còn nếu
chọn 5000 thì ngay sau khi máy tải xong là có thể thoát ra khỏi Internet được rồi. Sau đó,
trong mục "Hạn chế năm - tháng truy cập"(Entrez date limit), nên gĩư nguyên mặc định là"No
limit', trừ khi biết rõ chỉ cần truy cập tài liệu trong một số năm nào đó kể từ năm nay 2000,
thì nhấn mũi tên để chọn 2,3,5, 10...năm. Sau cùng nhấn "Search". Thường phải chờ 30- 60
giây hay l-2 phút để máy tải về hết các tài liệu tìm được.
Bước hai, là chọn chi tiết. Sau khi nhấn Search, PubMed sẽ đưa ra một danh sách các
tài liệu tìm được sắp xếp theo thứ tự ưu tiên sau: những bài báo có nội dung gần đúng nhất
với yêu cầu được xếp trước và bài báo mới xuất bản được xếp trước. Thí dụ, từ năm 1967
đến năm 1998 có 101 tài liệu có liên quan đến "sỏi thận san hô". Ðọc lướt qua tựa bài, sẽ
giúp chọn bài báo nào gần đúng với yêu cầu tìm kiếm nhất. Ví dụ nếu ta quan tâm đến "Biến
chứng thần kinh của sỏi san hô" thì bài cùa tác giả Fulford là một trong những bài báo đúng
yêu cầu. Tiếp theo, nhấn mục "[See Related Articles]"sẽ giúp khu trú nhanh chóng các bài báo
cần tìm. PubMed sẽ trình bày một danh sách khác gọn hơn và phù hợp với yêu cầu tìm kiếm
1
hơn. Tuy nhiên danh sách này vẫn còn dài và vẫn còn những bài báo không đúng yêu cầu tìm
kiếm. Hãy lưu danh sách này lại (chọn File - Save as), thoát ra khỏi mạng và sang bước 3.
Bước 3, cắt lọc dư thừa bằng Word 97 hay Word 2000. Máy phải có Word 97 hay
Word 2000 (tốt hơn) để mở được tập tin (file) lưu dưới dạng *.htm. Mở Word, mở tập tin
vừa lưu (ví dụ lưu dưới tên "stsanho.htm"). Sau đó, nhờ các tính năng của Word, cắt bỏ các
tài liệu không liên quan gì đến việc tìm kiếm mà PubMed thường hay lấy dư ra. Lúc này đã
thoát ra khỏi Internet rồi, nên cứ thong thả mà chỉnh sửa, không phải trả tiền vào mạng nữa.
Nếu phải đi đến các cửa hàng vi tính cho thuê máy vào mạng Internet, hay vào Internet bằng
máy của cơ quan, thì lưu (ở bước 2) vào đĩa mềm, rồi mang về nhà chỉnh sửa sau. Kế tiếp,
nên sắp xếp lại các tài liệu theo từng tên tạp chí, để dễ lục tìm tài liệu trong thư viện sau
này. Ví dụ, sắp các tài liệu thuộc vần "J Urol" gần lai nhau, các tài liệu của "Br J Urol" sát kế
nhau...
Bước 4, tìm phần tóm tắt (abstract) và tài liệu đầy đủ (full text). Mở tập tin đã chỉnh
sửa, kết nối vào Internet. Những tài liệu có ghi "no abstract available" thì không thể lấy phần
tóm tắt từ PubMed được. Các tài liệu khác, nhấn vào tên tác giả, PubMed sẽ hiện ra phần
tóm tắt. Lưu lại hay in ra giấy. Ðể lấy được tài liệu đầy đủ, có thể: - Nhấn vào tên tác giả,
PubMẹd trình bày tên tài liệu, tác giả... Bên dưới, nhấn vào "order", phải trả tiền bằng thẻ
tín dụng. Giá khoảng 3 USD cho một trang.
Nếu may mắn, bài báo cần tìm nằm trong tạp chí mà PubMed kết nối tới được thì có
thể lấy được fulltext miễn phí. Nhấn mục "Journal Browser" ở trang chủ của PubMed, vào
tiếp "list of journals with links to full-text", tìm tên tạp chí, nhấn vào đó và tiếp tục theo chỉ
dẫn. Lưu ý tới chữ viết tắt của PubMed, ví dụ "J Urol"= Journal of Urology.
Tìm tạp chí tại thư viện. In danh sách tài liệu đã chỉnh sửa ra giấy rồi đi tìm tài liệu
tại các thư viện bệnh viện hay trường đại học ( Cã thÓ t×m ®îc toµn v¨n hay
tãm t¾t).
Gửi thư cho tác giả để xin bài. Ðây là chuyện rất bình thường tại phương Tây. Chính
các thư ký trong khoa lo việc photocopy và gửi bài báo cho người xin. Trong thư xin tài liệu
chỉ cần ghi ngắn gọn: tên và địa chỉ người gửi, tên và địa chỉ người nhận, tên bài báo và xuất
xứ. Thường họ trả lời vì mỗi khoa, bệnh viện có một quỹ nghiên cứu khoa học để trả tiền
cho các công việc trên.
C á c c á c h t ì m ếm khác trên PUBMED
ki
1.Tìm tài liệu dựa vào họ của tác giả. Nếu biết họ (last name) của tác giả và
muốn tìm những bài báo do tác giả đó viết hay cùng viết, ví dụ tên tác giả là "Hage", đánh
tên vào mục Search, rồi làm tuần tự các bước đã nêu trên. Nếu biết rõ tên (first names) cuả
tác giả là Joris Joris thì đánh như sau: Hage J.J., sẽ giúp khu trú việc tìm kiếm.
2. Tìm một tài liệu khi biết rõ tên bài báo, tác giả, xuất xứ. Trên trang chủ của
PubMed, nhấp "Citation Matcher", rồi điền các chi tiết (tên bài báo và tên tác giả có thể
không cần điền), PubMed sẽ giúp tìm tài liệu nhanh chóng, kèm theo phần tóm tắt nếu có.
Một lưu ý quan trọng: Hằng năm, nội dung MEDLINE của cả năm đều được
cập nhật vào vài đĩa CD Rom mang tên SilverPlatter và được bày bán hoặc cho mượn
tại các thư viện lớn. Bạn có thể có được các thông tin quí giá đó mà lại tốn rất ít tiền
nếu tìm và xem trên CD Rom đó. Bạn cần cài đặt phần mềm WinSPIRS để đọc và rút
thông tin từ CD MEDLINE ( mời bạn xem ví dụ về thông tin trích rút trên trang sau)….
Thai Nguyen, le 1er Janvier 2003
Dr. Nguyen Hong Ninh
Faculté de Médecine de Thai Nguyen
2
MỘT SỐ TÀI LIỆU THAM KHẢO VỀ BỆNH VIÊM RUỘT THỪA CẤP
(VÍ DỤ CHO BIÊN TẬP TỪ CD MEDLINE 2001)
Biên tập: Dr. Nguyễn Hồng Ninh
Departement de Chirurgie
Faculté de Médecine de Thai Nguyên
Dưới đây là một và tài liệu trong số 173 tài liệu tìm thấy trong Cd thứ nhất
Medline 2001 được cập nhật có từ " appendicitis " (Viêm ruột thữa )
TI - TITLE: Les appendicites aigues au Centre National Hospitalier Universitaire de
Bangui, Centrafrique: aspects epidemiologiques, cliniques, paracliniques et
therapeutiques.
[Acute appendicitis at the National University Hospital in Bangui, Central African
Republic: epidemiologic, clinical, paraclinical and therapeutic aspects]
AU - AUTHOR: Zoguereh,-D-D; Lemaitre,-X; Ikoli,-J-F; Delmont,-J; Chamlian,-A;
Mandaba,-J-L; Nali,-N-M
AD - ADDRESS OF AUTHOR: Centre de formation et de recherche en medecine et
sante tropicales (Pr J. Delmont), Hopital Nord, chemin des Bourrelys, 13015 Marseille,
France. [email protected]
SO - SOURCE: Sante. 2001 Apr-Jun; 11(2): 117-25
PY - PUBLICATION YEAR: 2001
LA - LANGUAGE: French; Non-English
CP - COUNTRY OF PUBLICATION: France
AB - ABSTRACT: We carried out a retrospective study to analyse clinical, paraclinical
and therapeutic aspects of acute appendicitis cases as the National University Hospital
(CNHU) at Bangui in the Central African Republic. We compared our findings with those
for other African countries and for industrialized countries. From September 15 1990 to
February 15 1992, 285 patients underwent laparotomy to treat acute appendicitis. We
carried out a study of clinical, paraclinical and therapeutic aspects on 57 patients with
complete case histories (20% of the patients undergoing surgery). The appendices of
these patients were sent to the Laboratory of Pathological Anatomy of the Faculty of
Medicine at Marseille, France, for analysis. The frequency of appendectomy among
patients undergoing visceral surgery by laparotomy with no acute traumatic abdominal
syndrome was 42.3%. The incidence of appendectomy for the city of Bangui in 1991
was 36.5 per 100,000 inhabitants. These cases of appendicitis were diagnosed
essentially on clinical grounds. Leukocyte counts exceeded 10,000 per mm3 in 30% of
the patients. Histological examination revealed the presence of parasites in 10 cases :
Schistosoma mansoni eggs (seven cases) and Ascaris lumbricoides eggs (one case) in
patients with acute appendicitis and one case each of Schistosoma mansoni eggs and
Ascaris lumbricoides eggs at the time of diagnosis but normal histological results for
the removed appendix. Most of the patients consulted late, a mean of four days after
the onset of symptoms. The frequency of appendectomy on principle was 12.7% and
parenteral antibiotic treatment was prescribed systematically follow- ing surgery. The
3
mean duration of hospital stay after surgery was 7.6 days. No early postoperative
complications were noted. However, two late postoperative complications resulting in
the death of the patient were observed, giving a mortality rate of 3.5%. These
complications were one case of peritonitis after appendectomy involving intestinal
resection and one case of occlusive syndrome with septic shock. The frequency of
acute appendicitis at the CNHU at Bangui was similar to that reported in another
tropical African country (~ 1%). However, the incidence of appendectomies at Bangui
is lower than generally reported for western countries (15 to 40%). Positive diagnosis
was made on classic data obtained on clinical examination and on associated
biological data, if available. Parasites were identified on histological examination in
some cases of acute appendicitis, but it is unclear whether these parasites were
actually responsible for the appendicitis. Efficient examinations for the exploration of
acute nonspecific abdominal pain, such as the measurement of inflammation
indicators, particularly serum activated protein C levels, graded-compression
ultrasound scans and celioscopy, should be made available in the hospitals of African
countries to increase the precision of diagnosis and to decrease the still too high
frequency of appendectomies performed on principle. The postoperative mortality rate
at the CNHU of Bangui is higher than the low rates (0.1 to 0.25%) reported for
industrialized countries but is close to those reported for African countries. This high
rate of mortality results partly from the lateness of consultations, because patients in
tropical Africa often consult a traditional healer before resorting to modern medicine,
and partly from misdiagnoses.
TI - TITLE: Suspicion d'appendicite aigue. Interet de l'examen tomodensitometrique
helicoidal. Etude prospective chez 100 patients.
[Suspected acute appendicitis. Role of enhanced helical computed tomography.
Prospective study of 100 patients]
AU - AUTHOR: Bouillot,-J-L; Ruiz,-A; Alamowitch,-B; Capuano,-G; Aouad,-K;
Fourmestraux,-J; Vadrot,-D; Bethoux,-J-P
AD - ADDRESS OF AUTHOR: Service de chirurgie, Hotel-Dieu, 1, place du Parvis-
Notre-Dame, 75004 Paris, France. [email protected]
SO - SOURCE: Ann-Chir. 2001 Jun; 126(5): 427-33
PY - PUBLICATION YEAR: 2001
LA - LANGUAGE: French; Non-English
CP - COUNTRY OF PUBLICATION: France
AB - ABSTRACT: AIM OF STUDY: To assess the diagnosis accuracy of helical
computed tomography (CT) in patients with suspected appendicitis. PATIENTS AND
METHODS: This prospective study included 100 consecutive patients hospitalized for
suspected appendicitis. There were 57 men and 43 women with a median age of 30
years (range: 17-91). An enhanced helical CT was performed at admission, without
digestive opacification. Four criteria were interpreted as positive signs for appendicitis:
appendix enlarged > or = 7 mm, right lower quadrant inflammation, stercorolith, and
peri-appendicular collection. The patient was managed by the surgeon without
knowing the result of CT. The final diagnosis was made pathologically. RESULTS:
Eighty-one patients were operated on laparoscopically for suspected appendicitis.
Intraoperative diagnosis was corrected in three cases and 78 appendectomies were
performed (73 histological appendicitis, six normal appendix). Final diagnosis was a
4
medical disease in 19 patients. The findings of 67 CT were interpreted as positive (63
true positive and four false positive) and the findings of 33 CT were interpreted as
negative (24 true negative, nine false negative). Sensitivity was 87%, specificity was
86%, positive predictive value was 94%, and negative predictive value was 73%. If the
nine false negative cases with minimal lesions at pathological examination were
considered as true negative, the rates would be 100%, 89%, 94%, 100%, respectively.
CONCLUSION: Enhanced helical CT is a good imaging diagnostic tool for suspected
appendicitis. It may reduce the number of patients admitted for observation and
decrease the rate of negative appendectomy.
TI - TITLE: Active observation of children with possible appendicitis does not
increase morbidity.
AU - AUTHOR: Kirby,-C-P; Sparnon,-A-L
AD - ADDRESS OF AUTHOR: Department of Paediatric Surgery, Women's and
Children's Hospital, Adelaide, South Australia, Australia.
SO - SOURCE: ANZ-J-Surg. 2001 Jul; 71(7): 412-3
PY - PUBLICATION YEAR: 2001
LA - LANGUAGE: English
CP - COUNTRY OF PUBLICATION: Australia
AB - ABSTRACT: BACKGROUND: Attempts to maximise diagnostic accuracy and
reduce unnecessary surgery have led to the hospital observation of children with
suspected appendicitis but unconvincing physical signs. However, morbidity
associated with perforation necessitates the prompt management of acute
appendicitis and increases anxiety concerning prolonged preoperative observation.
METHODS: To assess the preoperative delay and subsequent complications associated
with active observation of appendicitis, we reviewed the records of 378 children who
had an appendicectomy performed at the Women's and Children's Hospital during a 4-
year period. RESULTS: Active observation was associated with an overall diagnostic
accuracy of 93%. The mean preoperative hospital time was 12 h. The incidence of
gangrene or perforation was 32%, with a mean preoperative hospital time in this group
of 7 h. In view of the short preoperative waiting time in this group, we do not believe
perforation in hospital to have been a frequent occurrence. The overall incidence of
postoperative infective complications was 4%, with an incidence of 12% following
perforation. CONCLUSIONS: Children with advanced disease often have convincing
signs on presentation and are not usually subjected to a significant delay. Active
observation is not associated with high postoperative morbidity.
TI - TITLE: Effect of cross-sectional imaging on negative appendectomy and perforation
rates in children.
AU - AUTHOR: Applegate,-K-E; Sivit,-C-J; Salvator,-A-E; Borisa,-V-J; Dudgeon,-D-L;
Stallion,-A-E; Grisoni,-E-R
5
AD - ADDRESS OF AUTHOR: Department of Radiology, Rainbow Babies and Children's
Hospital of the University Hospitals of Cleveland and Case Western Reserve University
School of Medicine, 11100 Euclid Ave, Cleveland, OH 44106-5056, USA.
[email protected]
SO - SOURCE: Radiology. 2001 Jul; 220(1): 103-7
PY - PUBLICATION YEAR: 2001
LA - LANGUAGE: English
CP - COUNTRY OF PUBLICATION: United-States
AB - ABSTRACT: PURPOSE: To compare negative appendectomy and perforation
rates in children who underwent ultrasonography (US), computed tomography (CT), or
no imaging before urgent appendectomy. MATERIALS AND METHODS: All children who
underwent urgent appendectomy during a 4(1/2)-year period were identified in a
surgical billing database. Pathology reports were coded as negative or as showing
acute inflammation or perforation. Imaging up to 14 days before appendectomy or
abscess drainage was noted, and imaging-based diagnoses were compared with
pathologic findings. Patient age and sex were recorded. RESULTS: Two hundred ninety-
nine children, 176 (59%) male and 123 (41%) female (mean age, 10.4 years; age
range, 1--21 years), underwent urgent appendectomy. One hundred twenty-six (42%)
underwent no imaging, 121 (41%) underwent US with or without CT, and 52 (17%)
underwent CT only; 44 (15%) underwent both US and CT. There were significantly
higher rates of appendectomy with normal pathologic findings ("negative
appendectomy") in patients who underwent no imaging (14% [18 of 126]) or US (17%
[20 of 121]) versus the rates in those who underwent CT only (2% [one of 52]) (P =.02
and P =.007, respectively). The negative appendectomy rate was 7% in 96 patients
who underwent CT with or without prior US. The perforation rates were not
significantly different. CONCLUSION: As compared with children who underwent no
preoperative imaging and those who underwent US, children who underwent CT had a
significantly lower negative appendectomy rate, without a significantly higher
perforation rate.
TI : Antibioticoterapia en peritonitis secundaria: hacia una definicion de su duracion
optima.
[Antibiotic therapy in secondary peritonitis: towards a definition of its optimal duration]
AU : Alcocer,-F; Lopez,-E; Calva,-J-J; Herrera,-M-F
AD: Departamento de Cirugia, Instituto Nacional de Ciencias Medicas y Nutricion
Salvador Zubiran, Mexico, D.F.
SO: Rev-Invest-Clin. 2001 Mar-Apr; 53(2): 121-5
PY: 2001
LA: Spanish; Non-English
CP: Mexico
AB: The optimal time period of antibiotic treatment in secondary peritonitis is still
unknown. AIM: To prospectively evaluate: 1) The preferred time period of antibiotic
treatment in secondary peritonitis by means of a survey applied to a sample of
surgeons, and 2) The outcome of a series of patients with secondary peritonitis in
whom the length of antibiotic treatment was based on clinical and laboratory
indicators. PATIENTS AND METHODS: A survey presenting the case of a patient with
acute appendicitis and secondary peritonitis was applied to 100 Mexican surgeons. The
optimal length of antibiotic treatment in that particular patient was asked. Results
6
were tabulated and analyzed. Subsequently, 35 patients with secondary peritonitis
were prospectively evaluated. Antibiotics were discontinued when fever relapsed and
the white blood count normalized. Clinical characteristics, diagnosis, surgical
treatment and outcome were analyzed. Recurrence of sepsis was investigated as the
main outcome variable. RESULTS: The survey revealed that 96% surgeons
recommended antibiotic treatment for a period longer than one week. In our study
group median age was 33 years, 21 were male and 14 female. All patients had a
surgical abdominal condition associated to secondary peritonitis. Median period of
antibiotic treatment was 3 days. In a follow-up of one month there was no persistent or
recurrent sepsis in any patient. CONCLUSIONS: This information may impact in
determining the total length of antibiotic therapy if our results are reproduced in
studies with more patients.
…………………
Thai Nguyªn, le 20/9/2005
Dr. Nguyen Hong Ninh
Message électronique : [email protected] hoÆc [email protected]
..................................
……………………………………………………………………………..
7
